LG&IG(Lab of Generative and Interactive Genomics)专注于后基因组时代的研究。实验室的核心目标是挖掘并生成新的基因组数据、理解和总结生物学基本规律、利用基因组学数据从基因型预测表型以及推进基因组学在临床诊疗、工程和产业中的应用。
深度突变扫描(Deep Mutational Scanning,DMS)与人工智能(AI):自基因组计划实施以来,遗传学和分子生物学迅速发展,基因组信息的挖掘、分析、注释与应用得到了广泛关注与发展。伴随着技术的进步,遗传和表型数据的规模呈指数增长。随着AI技术的不断进步,生物学的研究范式也正经历深刻变革。DMS作为一种创新的高通量基因型-表型数据生成技术,得益于DNA合成与测序技术的迅猛发展,成为研究热点。
不同于大多数现有的数据挖掘方法,DMS通过主动生成饱和突变进行人工高通量基因变异,对相应表型高通量定量测量,完成突变层面的数据生成与分析。其数据是从基因注释到突变注释,从基因操作到剪辑操作的基本信息。发展与应用DMS,挖掘与生成新的高通量基因型表型数据,革新生物学研究范式,为后基因组时代的生物学发展提供助力。
生物大分子的功能研究是生物学的核心问题。变构调控是生物大分子功能调控的一种调控机制,其通过扰动非活性中心改变构象来调节活性。变构调控参与酶催化,信号转导,转录调控与代谢调控等重要生命过程。研究变构调控机制有助于相关疾病的诊断与治疗以及扩展生物大分子的工程化应用。生物大分子的变构调控其相互作用是先行科学问题。利用DMS研究生物大分子之间及其与小分子化合物的互作能够提供广阔的数据基础,推进对其机制的理解并加快其应用的实现。
实验室具体研究方向是:
定量生物大数据挖掘与生成方法的开发与应用
基于定量生物大数据的生物大分子的变构调控机制的研究
基因突变在疾病中的研究与转化
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